Det opplyser AGF på sitt nettsted. Knudsen har spilt for Lillestrøm i første del av 2023-sesongen.
Overgangen til Danmark kommer i stand som følge av Fifa-ordningen der spillere fra Russland og Ukraina kan spille andre steder som følge av krigen.
Knudsen rakk bare å spille syv minutter for Rostov før han ble leid tilbake til Lillestrøm i fjor. Han har spilt 10 kamper for LSK denne sesongen.
I AGF er Stig Inge Bjørnebye sportssjef, mens Uwe Rösler er hovedtrener.
– Magnus er en allsidig og sterk midtbanespiller som shar vist et høyt nivå i flere sesonger i Eliteserien og på de norske U-landslagene, sier Bjørnebye.
– Jeg har fulgt ham tett og sett ham mange ganger for Lillestrøm, både før han dro til Rostov og senere. Magnus er en virkelig dyktig og talentfull midtbanespiller som kan fylle flere posisjoner. Han har det DNA-et vi leter etter i AGF-spillere, sier Rösler.
Knudsen har allerede sluttet seg til AGF-troppen, som åpner superligasesongen med hjemmekamp mot Vejle 23. juli.